密林神庙的建设与云野神庙有巨大的不同；当黑石被发现并送往云野时，云野神庙的轮廓已经基本完成，能改造的地方不多；可密林神庙，父亲在一开始便设计了大量的黑石科技机关。

在神庙建设地点到荧光森林尽头之间，有一片巨大的空地，之所以这里始终空置，是因雨水来临时，这块空地会变成湖泊。于是父亲设计了这样一套方案。

这块空地作为沟通森林和神庙的通路，在地面铺设走道后，每隔一段路建一座高亭，亭中设置黑石开关，当下雨时道路被淹没，便可点亮亭中的黑石开关，使道路上升上与高亭相接形成廊桥。

密林神庙本身建造在水平的地上，但父亲还是找到了让其仿似在高处的方法。他将大门的位置抬到比廊亭还高；如果从地面走过去到达神庙底部，需要爬百十来层台阶才能到达门口。这样也保留了朝圣的初衷。

神庙的内部，父亲设计了三步式的黑石移动阶梯，十分精巧。由于前些年的争执，母亲并没有如往常一样参与到密林神庙的内部装潢设计，但她仍然同意了协助进行内部工材的打造。

那次的争执让父母之间产生了些裂隙，父亲甚至不愿在休息时回家，而是在神庙内部的高台下为自己打造了一间临时的卧室。